Aunque hay opiniones para todos los gustos, yo creo que lo más lógico a la hora de calcular la hidratación de la masa es tener en cuenta toda la harina y toda el agua, así que en mi opinión, el cálculo correcto es el de flush.
Anitamor, un 60% es más bien poco, pero no debería salir un pan duro por eso, la fermentación se encarga de llenar la masa de gas. El pan candeal se hace con una masa hidratada al 45% (eso sí que es una piedra) y su miga es esponjosa.
De todas formas, si la masa te parece dura prueba a añadir un poco más de agua. Para esa cantidad de harina y de mm, con 25 gr más de agua subes la hidratación al 65%, que seguramente te gustará más.
Una foto de tus panes ayudaría a entender mejor lo que les pasa.
Flush, no faltan kilotones de agua, solamente una pizquilla